激發和發射波長:需與(yu) 實驗中使用的激發光源和檢測設備的光學濾光片相匹配。例如,若儀(yi) 器配備的是常見的 488nm 激光光源,那麽(me) 選擇在此波長附近有強吸收峰的熒光染料,如 FITC(異硫氰酸熒光素)等,能更好地被激發產(chan) 生熒光信號。同時,發射波長要能被檢測設備有效檢測和區分,避免不同熒光信號之間的幹擾。
熒光強度和穩定性:選擇熒光強度高的染料,可提高檢測的靈敏度,便於(yu) 觀察和定量分析。例如,在對低表達量的目標分子進行標記時,如量子點等熒光強度較高的染料就更具優(you) 勢。此外,染料的熒光穩定性也很重要,要能在實驗過程中保持熒光信號的穩定,減少光漂白現象,以確保長時間觀察或多次測量時結果的準確性。
細胞通透性和毒性:對於(yu) 活細胞染色,染料需要能夠穿透細胞膜進入細胞內(nei) ,且對細胞的生理功能和活性無明顯影響。像 Calcein - AM 這種能被細胞內(nei) 酯酶水解而保留在細胞內(nei) 的染料,就比較適合活細胞標記。同時,要選擇細胞毒性低的染料,以免影響細胞的正常生長、代謝和功能,導致實驗結果出現偏差。
特異性和親(qin) 和力:染料應對目標分子或細胞結構具有高度的特異性和親(qin) 和力,能夠準確地標記目標物,減少非特異性結合。例如,Hoechst 染料對 DNA 具有特異性結合能力,可準確標記細胞核,用於(yu) 觀察細胞核的形態和分布。
多色標記兼容性:在進行多色熒光標記實驗時,要選擇發射光譜相互區分明顯、無重疊或重疊較少的熒光染料,以避免不同熒光信號之間的串擾。如在同時標記細胞內(nei) 不同細胞器或多種蛋白質時,可選擇 FITC(綠色熒光)、TRITC(四甲基異硫氰酸羅丹明,紅色熒光)和 CY5(菁染料,遠紅光熒光)等組合,它們(men) 的發射光譜差異較大,能實現清晰的多色成像。
實驗成本:不同熒光染料的價(jia) 格差異較大,在滿足實驗要求的前提下,需要考慮成本因素。對於(yu) 一些常規的、對染料性能要求不是特別苛刻的實驗,可選擇性價(jia) 比高的染料;而對於(yu) 一些高精度、高要求的實驗,則需優(you) 先考慮染料的性能,再綜合考慮成本。