18501609238
不同類型的電泳實驗在凝膠製備和氣泡處理上有哪些特殊要求?
凝膠製備特殊要求
凝膠濃度選擇:根據目標蛋白質的分子量大小選擇合適的凝膠濃度。一般來說,分離小分子蛋白質(<20 20="" 60="" -="">60 kDa)則使用 7% - 8% 的凝膠。
嚴(yan) 格控製試劑比例:丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺的比例、緩衝(chong) 液的 pH 值以及引發劑和加速劑的用量等都要精確控製,以保證凝膠的聚合效果和孔徑大小均勻性。例如,通常使用的分離膠緩衝(chong) 液 pH 為(wei) 8.8,濃縮膠緩衝(chong) 液 pH 為(wei) 6.8,過硫酸銨和四甲基乙二胺(TEMED)的用量要根據具體(ti) 實驗條件進行優(you) 化,一般過硫酸銨的濃度在 0.1% - 0.5%,TEMED 的濃度在 0.05% - 0.1%。
氣泡處理特殊要求:由於(yu) SDS - PAGE 電泳對條帶的分辨率要求較高,凝膠中的氣泡會(hui) 嚴(yan) 重影響蛋白質的遷移和分離效果,因此在氣泡處理上要更加嚴(yan) 格。在凝膠灌注過程中,可采用長針頭注射器將凝膠溶液緩慢注入電泳槽中,盡量避免溶液與(yu) 空氣接觸產(chan) 生氣泡。如果發現凝膠中有氣泡,應及時用細針挑破或采用振動法使氣泡排出,確保凝膠中無氣泡存在,以獲得清晰、整齊的蛋白質條帶。
瓊脂糖純度和濃度:根據分離的核酸片段大小選擇合適的瓊脂糖濃度。一般來說,分離小於(yu) 0.5 kb 的 DNA 片段,可使用 2.0% - 3.0% 的瓊脂糖凝膠;分離 0.5 - 2 kb 的 DNA 片段,常用 1.0% - 1.5% 的凝膠;而對於(yu) 大於(yu) 2 kb 的 DNA 片段,則使用 0.7% - 1.0% 的瓊脂糖凝膠。同時,要選擇高純度的瓊脂糖,以減少雜質對核酸遷移的影響。
加熱溶解均勻:在製備瓊脂糖凝膠時,需要將瓊脂糖粉末加入到緩衝(chong) 液中加熱溶解。加熱過程中要不斷攪拌,確保瓊脂糖溶解,避免出現局部濃度過高或過低的情況。溶解後的瓊脂糖溶液要冷卻至適當溫度(一般為(wei) 50 - 60℃)後再倒入模具中,防止溫度過高導致凝膠收縮或產(chan) 生氣泡。
氣泡處理特殊要求:瓊脂糖凝膠電泳中氣泡的存在可能會(hui) 導致核酸條帶變形或出現斷裂現象。在倒入瓊脂糖溶液時,動作要平穩,避免產(chan) 生氣泡。如果有氣泡產(chan) 生,可以用吸管將其吸出,或者待凝膠凝固後,用刀片將含有氣泡的部分切除。對於(yu) 一些低熔點瓊脂糖凝膠,由於(yu) 其凝固點較低,在處理氣泡時要注意保持環境溫度穩定,避免凝膠在處理過程中融化。
兩(liang) 性電解質選擇:等電聚焦電泳需要使用兩(liang) 性電解質來形成 pH 梯度。不同的樣品需要選擇合適的兩(liang) 性電解質混合物,其 pH 範圍要涵蓋目標蛋白質的等電點。例如,對於(yu) 等電點在 4 - 6 之間的蛋白質,可選擇 pH 3 - 10 的兩(liang) 性電解質,並適當調整其比例,以獲得更精確的 pH 梯度。
凝膠聚合條件精確控製:凝膠的聚合過程要嚴(yan) 格控製溫度、時間和引發劑的用量,以確保凝膠中 pH 梯度的穩定性和準確性。一般在低溫(4 - 10℃)下進行聚合,聚合時間相對較長,可能需要數小時甚至過夜。引發劑的用量要根據具體(ti) 的凝膠配方和實驗條件進行優(you) 化,以保證凝膠聚合均勻,pH 梯度穩定。
氣泡處理特殊要求:等電聚焦電泳中氣泡的存在會(hui) 幹擾 pH 梯度的形成,影響蛋白質的聚焦效果。在凝膠製備過程中,要盡量避免氣泡的產(chan) 生。如果出現氣泡,應采用溫和的方法去除,如使用細針小心地將氣泡挑出,或者在凝膠表麵覆蓋一層液體(ti) 石蠟,防止空氣進入凝膠產(chan) 生氣泡。同時,在電泳過程中,也要注意觀察凝膠中是否有新的氣泡產(chan) 生,如有需要及時處理。
在線交流
微信掃一掃
返回頂部