您好!歡迎訪問米兰俱乐部足球推荐计划網站!
全國服務谘詢熱線:

18501609238

當前位置:首頁 > 技術文章 > Illumina FC-126-1004 TruSeq Synthetic Long-Read 技術介紹

Illumina FC-126-1004 TruSeq Synthetic Long-Read 技術介紹

更新時間:2025-05-19      點擊次數:169
Illumina FC-126-1004 TruSeq Synthetic Long-Read 技術介紹
在基因組學研究領域,獲取高質量、長讀長的測序數據對於深入解析基因組結構與功能至關重要。Illumina 公司推出的 FC-126-1004 TruSeq Synthetic Long-Read 產品,為科研人員提供了創新的解決方案,有效克服了傳統短讀長測序的局限性,在基因組組裝、基因分型等多個方麵展現出顯著優勢。
一、產品概述
TruSeq Synthetic Long-Read 是一款用於構建 DNA 文庫以生成合成長讀長序列的產品,其配套的文庫製備試劑盒和條形碼試劑盒協同工作,為複雜基因組研究提供了有力工具 。該產品並非直接生成物理意義上的長讀長測序數據,而是通過巧妙的技術手段,將短讀長數據進行整合與處理,最終合成出具有長讀長特性的序列信息。這一創新策略使得在 Illumina 現有測序平台基礎上,能夠實現近似長讀長測序的效果,大大拓展了常規測序平台的應用範圍。
二、核心技術原理
  1. 高度並行的文庫製備:TruSeq Synthetic Long-Read 技術首先對 DNA 樣本進行高度並行的文庫製備 。將基因組 DNA 隨機片段化後,在每個(ge) 片段兩(liang) 端連接上特定的接頭序列。這些接頭不僅(jin) 有助於(yu) 後續的 PCR 擴增和測序反應,還包含了用於(yu) 識別和追蹤不同 DNA 片段的索引信息。通過這種方式,大量的 DNA 片段被同時處理,為(wei) 後續生成合成長讀長奠定了基礎。

  1. 短讀長數據的本地組裝:在測序過程中,首先按照常規的 Illumina 測序方法獲得大量短讀長序列 。這些短讀長序列包含了原始 DNA 片段的部分信息。隨後,利用先進的算法和生物信息學工具,對這些短讀長數據進行本地組裝。通過識別短讀長之間的重疊區域,將它們(men) 逐步拚接起來,從(cong) 而構建出更長的合成序列。在這個(ge) 過程中,由於(yu) 每個(ge) 短讀長的測序準確性較高(Illumina 測序技術本身具有高準確性),通過合理的組裝策略,能夠有效降低合成長讀長中的錯誤率,保證最終序列的可靠性。

  1. 的索引與(yu) 拚接策略:配套的條形碼試劑盒發揮著關(guan) 鍵作用 。其中包含 384 個(ge) 索引,用於(yu) 標記每個(ge) 反應孔中的樣本。在測序完成後,利用這些索引信息,可以準確地將來自同一原始 DNA 分子的短讀長序列進行歸類和拚接。這種基於(yu) 索引的拚接策略,極大地提高了合成長讀長的準確性和成功率,能夠更精準地還原基因組的真實序列,尤其是在處理高度重複序列區域時,相比傳(chuan) 統短讀長測序,能夠有效減少序列錯配和遺漏的問題。

三、產品性能優勢
  1. 高準確性的長讀長合成:TruSeq Synthetic Long-Read 技術生成的合成長讀長具有的準確性,錯誤率可低至 0.03%/ 堿基 。這一的性能得益於(yu) 其基於(yu) 高質量短讀長數據的組裝方式,以及嚴(yan) 格的質量控製流程。高準確性的長讀長數據對於(yu) 準確識別基因組中的變異,如單核苷酸多態性(SNP)、插入缺失(InDel)以及結構變異(SV)等至關(guan) 重要。在研究複雜疾病的遺傳(chuan) 機製時,能夠精準地檢測到與(yu) 疾病相關(guan) 的微小變異,為(wei) 疾病診斷和治療提供可靠依據。

  1. 出色的基因組覆蓋度:通過優(you) 化的文庫製備和長讀長合成策略,該產(chan) 品能夠實現對基因組的全麵覆蓋 。尤其是對於(yu) 傳(chuan) 統測序方法難以觸及的高 GC 含量區域、重複序列區域以及基因間區等複雜區域,TruSeq Synthetic Long-Read 技術能夠有效提升覆蓋度。在對動植物基因組進行測序時,能夠更完整地獲取基因組信息,挖掘出更多潛在的功能基因和調控元件,為(wei) 物種進化、遺傳(chuan) 育種等研究提供更豐(feng) 富的數據資源。

  1. 強大的複雜區域解析能力:基因組中的重複序列和結構變異往往是研究的難點,因為(wei) 它們(men) 容易導致測序數據的混淆和錯誤拚接 。TruSeq Synthetic Long-Read 技術憑借長讀長優(you) 勢,能夠跨越這些複雜區域,準確解析重複序列的結構和分布,精確識別各類結構變異,如倒位、易位等。在腫瘤基因組研究中,能夠清晰地揭示腫瘤細胞中基因組的重排和變異情況,有助於(yu) 深入了解腫瘤的發生發展機製,為(wei) 腫瘤的精準治療提供關(guan) 鍵線索。

四、應用領域
  1. 基因組從(cong) 頭組裝:在新物種基因組測序和未知基因組研究中,基因組從(cong) 頭組裝是關(guan) 鍵步驟 。TruSeq Synthetic Long-Read 技術生成的長讀長數據能夠顯著提高組裝的連續性和準確性,有效減少基因組中的缺口和錯誤拚接。通過將合成長讀長與(yu) 傳(chuan) 統短讀長數據相結合,可以構建出更為(wei) 完整、準確的基因組草圖,為(wei) 後續基因注釋、功能研究等工作奠定堅實基礎。例如在對新發現的微生物基因組進行測序時,能夠快速、準確地完成基因組組裝,揭示其的遺傳(chuan) 信息和代謝途徑。

  1. 基因組結構變異分析:結構變異在生物進化、疾病發生發展等過程中發揮著重要作用 。該產(chan) 品能夠精準檢測基因組中的各種結構變異,包括拷貝數變異(CNV)、染色體(ti) 易位、倒位等。在人類遺傳(chuan) 學研究中,通過對大量個(ge) 體(ti) 的基因組進行結構變異分析,可以發現與(yu) 遺傳(chuan) 性疾病相關(guan) 的結構變異位點,為(wei) 疾病的早期診斷和遺傳(chuan) 谘詢提供重要依據。在植物育種領域,結構變異分析有助於(yu) 挖掘與(yu) 優(you) 良性狀相關(guan) 的基因,加速品種改良進程。

  1. 單倍型分析與(yu) 基因分型:準確的單倍型分析對於(yu) 理解遺傳(chuan) 多樣性、疾病關(guan) 聯分析以及群體(ti) 遺傳(chuan) 學研究具有重要意義(yi) 。TruSeq Synthetic Long-Read 技術能夠通過長讀長數據準確確定等位基因的連鎖關(guan) 係,實現高精度的單倍型分型。在人類群體(ti) 遺傳(chuan) 學研究中,通過分析不同人群的單倍型分布,可以追溯人類的遷徙曆史和遺傳(chuan) 演化路徑;在疾病研究中,單倍型分析有助於(yu) 識別與(yu) 複雜疾病易感性相關(guan) 的遺傳(chuan) 標記,為(wei) 個(ge) 性化醫療提供更精準的信息。

五、產品使用說明
  1. 樣本要求:該產(chan) 品適用於(yu) 多種類型的 DNA 樣本,如基因組 DNA、FFPE 樣本來源的 DNA 等 。為(wei) 確保實驗成功,樣本應具備較高的質量和完整性,建議使用高質量的純化 DNA,起始量一般在 0.1 - 1 μg 之間,具體(ti) 用量可根據樣本類型和實驗要求進行適當調整。在樣本處理前,需對樣本進行嚴(yan) 格的質量檢測,包括濃度測定、純度評估以及完整性分析等,確保樣本符合實驗要求。

  1. 實驗操作流程:使用 TruSeq Synthetic Long-Read 產(chan) 品構建文庫的操作流程相對簡便,但需嚴(yan) 格按照說明書(shu) 進行 。首先,將 DNA 樣本進行片段化處理,可采用物理或酶切方法,獲得適宜長度的 DNA 片段。然後,進行末端修複、加 A 尾以及連接特定接頭等操作,這些步驟均在試劑盒提供的專(zhuan) 用試劑和優(you) 化的反應條件下進行。接下來,利用條形碼試劑盒中的索引對樣本進行標記,以便後續區分不同樣本。最後,通過 PCR 擴增富集文庫片段,並對文庫進行純化和質量檢測,確保文庫的質量和濃度符合測序要求。

  1. 數據分析:測序完成後,可利用 Illumina BaseSpace Sequence Hub 中的專(zhuan) 用分析工具進行數據分析 。例如,TruSeq Long-Read Assembly App 能夠將短讀長數據組裝成合成長讀長,用於(yu) 準確的基因組組裝和基因組完成工作;TruSeq Phasing Analysis App 則可用於(yu) 基因組的基因分型分析,識別單倍型信息、共遺傳(chuan) 等位基因以及新出現的突變。這些分析工具操作簡便,能夠快速、準確地從(cong) 測序數據中提取有價(jia) 值的生物學信息,為(wei) 科研人員的研究工作提供有力支持。



米兰俱乐部足球推荐计划
地址:上海市奉賢區金大公路8218號1幢
郵箱:1006909781@qq.com
傳真:QQ1006909781
關注我們
歡迎您關注我們的微信公眾號了解更多信息:
歡迎您關注我們的微信公眾號
了解更多信息