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提高 SDS-PAGE 凝膠電泳分辨率的其他操作流程

更新時間:2025-06-20      點擊次數:313
除了降低溫度,優化實驗各環節的操作流程,同樣能顯著提升 SDS-PAGE 凝膠電泳的分辨率,幫助獲得更清晰、準確的蛋白質分離效果。
精準優化凝膠製備環節
  • 合理選擇凝膠濃度:依據目標蛋白質分子量精準匹配凝膠濃度是關(guan) 鍵。當分析小於(yu) 20kDa 的小分子蛋白質時,12% - 15% 的高濃度凝膠能提供更細密的分子篩效應,限製小分子蛋白質的遷移,實現精細分離;而對於(yu) 大於(yu) 100kDa 的大分子蛋白質,7% - 10% 的低濃度凝膠更合適,較大的孔徑可確保大分子順利通過凝膠。若樣品蛋白質分子量範圍跨度大,梯度凝膠(如 4% - 20%)能實現從(cong) 低濃度到高濃度的過渡,使不同大小蛋白質在凝膠的不同區域得到最佳分離 。

  • 嚴(yan) 格把控凝膠聚合:聚合過程中,溫度、催化劑用量都會(hui) 影響凝膠質量。將聚合溫度嚴(yan) 格控製在 20 - 25℃,能保證凝膠孔徑均勻;精確添加過硫酸銨(APS)和四甲基乙二胺(TEMED),APS 作為(wei) 引發劑,TEMED 加速聚合反應,二者比例失調會(hui) 導致凝膠聚合異常。同時,新鮮配製 APS 溶液,且 1 周內(nei) 使用,可保證其活性,避免因引發劑失效造成聚合、孔徑不均的問題。

精細處理樣品
  • 精準控製上樣量:上樣量過多會(hui) 使蛋白質在凝膠中過度堆積,導致條帶拖尾、重疊,嚴(yan) 重影響分辨率。一般每孔總蛋白上樣量控製在 10 - 20μg,純化蛋白質樣品 5 - 10μg 即可。使用校準後的微量移液器,緩慢且精準地吸取和添加樣品,防止樣品溢出汙染相鄰泳道,同時保證各泳道上樣量一致,避免因上樣差異幹擾分辨率。

  • 優(you) 化樣品變性處理:樣品與(yu) 上樣緩衝(chong) 液混合後,煮沸時間需精準控製。通常 5 - 10 分鍾為(wei) 宜,時間過短蛋白質無法充分變性,影響其在凝膠中的遷移;時間過長,部分蛋白質可能發生聚集,形成大分子複合物,改變遷移特性。對於(yu) 含大量二硫鍵的蛋白質,可適當延長煮沸時間至 10 分鍾,確保二硫鍵充分斷裂,使蛋白質伸展為(wei) 線性分子。

科學控製電泳過程
  • 優(you) 化電泳緩衝(chong) 液:Tris - 甘氨酸緩衝(chong) 液是常用選擇,但要確保其 pH 穩定在 8.3 左右,pH 波動會(hui) 改變蛋白質所帶電荷,影響遷移速度和分離效果。定期更換電泳緩衝(chong) 液,隨著電泳進行,緩衝(chong) 液中離子不斷消耗,離子強度改變會(hui) 影響電場穩定性和蛋白質遷移,一般連續使用 2 - 3 次後更換新緩衝(chong) 液。對於(yu) 對分辨率要求高的小分子蛋白質分離,可嚐試 MOPS 或 MES 緩衝(chong) 係統,它們(men) 能提供更穩定的 pH 環境和更好的分離效果。

  • 調整電泳電壓與(yu) 時間:降低電泳電壓並適當延長電泳時間,可使蛋白質在凝膠中遷移更充分,減少擴散,獲得更清晰條帶。例如,將電壓從(cong) 200V 降至 100V,雖然電泳時間延長,但蛋白質有更充足時間依據分子量差異進行分離,分辨率顯著提高。同時,采用分步電壓策略,開始用較低電壓(如 80V)使蛋白質在凝膠中均勻分布,再逐步升高電壓(如 120V)加快分離進程,也是提升分辨率的有效方法。

采用特殊電泳技術與設備
  • 運用梯度凝膠電泳:梯度凝膠的孔徑沿凝膠長度方向逐漸變化,蛋白質在遷移過程中,隨著孔徑變小,不同分子量蛋白質在合適孔徑處停止遷移,實現更精細分離。相較於(yu) 均一濃度凝膠,梯度凝膠能在同一凝膠上分離更寬分子量範圍的蛋白質,且條帶更銳利、分辨率更高,尤其適合複雜蛋白質混合物分析。

  • 選擇高質量預製膠與(yu) 設備:高質量預製膠經過嚴(yan) 格質量控製,凝膠濃度均一、聚合條件穩定,能減少因手工製膠誤差導致的分辨率降低問題。同時,確保電泳槽幹淨無汙染,殘留的 SDS、蛋白質會(hui) 幹擾電場分布和蛋白質遷移;使用精準控溫、穩定電場的電泳儀(yi) ,為(wei) 蛋白質分離提供穩定環境,也是提高分辨率的重要保障。

通過以上操作流程的優化,從凝膠製備到電泳結束的各個環節協同改進,能有效提升 SDS-PAGE 凝膠電泳的分辨率,為蛋白質研究提供更可靠、更清晰的實驗結果。



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