高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒和普通逆轉錄試劑盒的核心操作步驟大致相似,都是從樣本準備、反應體係配製到進行逆轉錄反應,但在具體細節和側重點上存在明顯區別。
高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒:由於(yu) 其對 RNA 樣本的兼容性較好,能適應部分降解或純度不太高的樣本,在樣本準備時,對 RNA 提取後的純度要求相對寬鬆。不過,為(wei) 保證獲得理想的高產(chan) 量 cDNA,仍需盡量去除可能影響逆轉錄反應的雜質,如多糖、多酚等。在麵對大量樣本時,樣本的批量處理能力較強,可高效完成多個(ge) 樣本的準備工作,以滿足後續大規模實驗對 cDNA 產(chan) 量的需求。
普通逆轉錄試劑盒:對 RNA 樣本質量要求較為(wei) 苛刻,通常需要高質量、高純度且完整性好的 RNA。在 RNA 提取過程中,需更嚴(yan) 格地按照操作規範進行,以確保提取的 RNA 純度達標(A260/A280 比值一般要求在 1.8 - 2.0 之間 )。若樣本存在降解或純度不佳,可能導致逆轉錄效率低下甚至失敗,所以往往需要對提取後的 RNA 進行更精細的質量檢測和純化處理,以保證逆轉錄反應順利進行。
高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒:為(wei) 實現高產(chan) 量 cDNA 合成,反應體(ti) 係的設計通常會(hui) 考慮加大 RNA 模板的投入量以及各反應成分的比例。以 Thermo 的高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒為(wei) 例,在 20μl 反應體(ti) 係中,可加入 2μg 總 RNA ,同時配套的緩衝(chong) 液、dNTPs、逆轉錄酶等試劑的用量也經過優(you) 化,以支持大量 RNA 的逆轉錄。此外,一些高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒會(hui) 將部分試劑進行預混,如整合為(wei) 2x RT 緩衝(chong) 液混合液和 20x 酶混合液(含逆轉錄酶和 RNase 抑製劑),減少移液步驟,方便實驗人員快速配製反應體(ti) 係,尤其適用於(yu) 處理大量樣本的情況。
普通逆轉錄試劑盒:反應體(ti) 係相對靈活,根據不同的實驗需求和樣本情況,RNA 模板的用量範圍較廣,從(cong) 幾十納克到幾微克不等。各試劑成分的比例也較為(wei) 常規,在配製過程中,需要實驗人員根據說明書(shu) 精確量取每種試劑,對操作的準確性要求較高。而且,普通逆轉錄試劑盒的試劑往往較為(wei) 分散,不像高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒有較多預混形式,因此在配製反應體(ti) 係時,移液操作步驟相對較多,耗時也可能更長。
高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒:標準反應時間一般較長,如 Thermo 的高容量 cDNA 逆轉錄試劑盒標準反應時間通常為(wei) 120 分鍾 。較長的反應時間是為(wei) 了確保在加大 RNA 模板量的情況下,逆轉錄酶能夠充分發揮作用,實現高效且穩定的 cDNA 合成,從(cong) 而獲得足夠量的 cDNA 產(chan) 物。在反應過程中,對反應溫度和時間的控製要求嚴(yan) 格,以保證逆轉錄反應的順利進行和產(chan) 物質量。
普通逆轉錄試劑盒:反應時間相對靈活,部分產(chan) 品可在較短時間內(nei) 完成逆轉錄反應,如一些快速逆轉錄試劑盒可在 30 - 60 分鍾內(nei) 完成。較短的反應時間適合對時間要求較高、樣本量較小的實驗,能夠快速獲得 cDNA 產(chan) 物用於(yu) 後續分析。不過,不同品牌和型號的普通逆轉錄試劑盒在反應時間上差異較大,實驗人員需要根據具體(ti) 產(chan) 品的說明書(shu) 來確定最佳反應條件。