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Illumina 腫瘤專用測序試劑盒：以精準參數賦能腫瘤研究突破

更新時間：2025-11-03 點擊次數：269

內容簡介

在腫瘤精準研究與臨床轉化進程中，測序試劑盒的性能參數直接決定基因突變檢測的準確性、腫瘤異質性解析的深度及臨床療效監測的可靠性。本文聚焦 Illumina 腫瘤研究領域四大核心測序試劑盒（TruSight Oncology 500、TruSight Oncology 500 ctDNA v2、TruSeq DNA PCR-Free、NextSeq 550Dx 測序試劑），係統拆解其在檢測基因範圍、靈敏度、樣本兼容性、測序質量等關鍵維度的核心參數，結合臨床腫瘤驅動基因篩查、液體活檢動態監測、全基因組突變圖譜構建等實際應用場景，驗證參數優勢如何轉化為研究價值。同時，關聯上海易匯生物的試劑供應服務，展現從 “參數保障" 到 “供應穩定" 的全鏈條支撐，為腫瘤研究機構選擇適配工具、推進科研項目提供參考。

關鍵詞

Illumina 腫瘤測序試劑盒、參數性能、檢測靈敏度、樣本兼容性、試劑供應服務

一、行業背景：腫瘤研究對測序試劑盒的參數化需求升級

隨著腫瘤研究從 “泛癌分析" 向 “精準分型" 邁進，科研人員對測序試劑盒的性能要求已從 “能檢測" 轉向 “精準檢測"—— 在肺癌驅動基因篩查中，需試劑盒能穩定檢出 0.5% 等位基因頻率（VAF）的 EGFR T790M 突變；在結直腸癌液體活檢中，需從 4mL 血漿中捕獲＜0.2% VAF 的 KRAS 突變；在黑色素瘤全基因組研究中，需覆蓋高 GC 區域（如 TERT 啟動子）且測序覆蓋度 CV 值＜8%。傳統測序試劑盒因參數短板（如靈敏度不足、樣本兼容性差），難以滿足上述需求，而 Illumina 通過持續優化核心參數，構建起覆蓋 “組織 - 液體 - 全基因組" 的腫瘤專用測序體係，成為推動腫瘤研究突破的關鍵工具。

二、四大核心試劑盒參數解析：精準匹配腫瘤研究需求

（一）TruSight Oncology 500：組織樣本多維度變異檢測的 “全能選手"

作為 Illumina 腫瘤組織測序的產品，TruSight Oncology 500（TSO500）以 “廣覆蓋、高靈敏" 參數特性，成為實體瘤驅動基因篩查的試劑盒：

檢測範圍與(yu) 變異類型：靶向覆蓋 523 個(ge) 腫瘤相關(guan) 基因，涵蓋單核苷酸變異（SNV）、插入缺失（Indel）、拷貝數變異（CNV）、基因融合四大變異類型，同時支持微衛星不穩定性（MSI）與(yu) 腫瘤突變負荷（TMB）計算，單個(ge) 試劑盒即可完成腫瘤分子分型所需的核心檢測內(nei) 容，無需多試劑盒組合，實驗效率提升 60%。

靈敏度與(yu) 特異性：采用 “超覆蓋度探針" 設計，每堿基覆蓋 30-50 條探針，針對 FFPE 組織樣本中 0.5% VAF 的突變，檢出率穩定達 98%，假陽性率＜0.1%—— 在某三甲醫院開展的 100 例肺腺癌 FFPE 樣本檢測中，該試劑盒對 EGFR 19Del、L858R 等常見突變的檢出率與(yu) Sanger 測序一致，對低頻突變（0.5%-1% VAF）的檢出率較傳(chuan) 統試劑盒提升 40%。

樣本兼容性：專(zhuan) 為(wei) 臨(lin) 床 FFPE 樣本優(you) 化，配備 TruSeq FFPE DNA Repair Mix 修複模塊，可修複甲醛固定導致的 DNA 交聯與(yu) 斷裂，修複效率達 80%，支持 DNA 用量低至 40ng、RNA 用量 40-80ng，即使對降解嚴(yan) 重（DNA 片段＜100bp、RNA 完整性數 RIN≥2.0）的 FFPE 樣本，仍能保持 85% 以上的檢測成功率，解決(jue) 臨(lin) 床珍貴樣本檢測難題。

（二）TruSight Oncology 500 ctDNA v2：液體活檢低頻突變捕獲的 “精準利器"

針對循環腫瘤 DNA（ctDNA）含量低、幹擾因素多的特性，TruSight Oncology 500 ctDNA v2 通過參數革新，實現液體活檢的高靈敏度檢測：

靈敏度與(yu) 樣本用量：基於(yu) 分子標識符（UMI）技術，對血漿中 0.2% VAF 的 SNV 檢出率≥95%，分析特異性≥99.995%（針對≥0.5% VAF 小變異），僅(jin) 需 4mL 血漿即可提取 20ng 循環遊離 DNA（cfDNA）完成檢測 —— 在某腫瘤中心開展的結直腸癌化療療效監測研究中，該試劑盒能穩定捕獲治療後患者血漿中 0.15% VAF 的 KRAS 突變，較傳(chuan) 統 ctDNA 試劑盒靈敏度提升 2 倍，提前 2-3 個(ge) 月預警疾病進展。

抗幹擾能力：試劑體(ti) 係添加血紅蛋白清除劑與(yu) 遊離 RNA 酶，可去除血漿中 90% 以上的血紅蛋白（避免抑製 PCR 反應）與(yu) 遊離 RNA（減少非特異性擴增），在溶血樣本（血紅蛋白濃度＞5g/L）中的檢測成功率仍達 90%，而傳(chuan) 統試劑盒在該條件下檢測失敗率超 50%。

檢測效率：從(cong) 核酸純化到變異報告僅(jin) 需 3-4 天，文庫製備可在 1 天內(nei) 完成，搭配 Illumina Dragen 二次分析流程，可自動生成突變注釋、TMB 計算、MSI 評分等結果，大幅縮短科研周期 —— 某科研團隊利用該試劑盒，30 天內(nei) 完成 50 例胰腺癌患者的 ctDNA 動態監測，成功篩選出 2 個(ge) 與(yu) 化療耐藥相關(guan) 的低頻突變位點。

（三）TruSeq DNA PCR-Free：全基因組腫瘤突變圖譜構建的 “深度工具"

在腫瘤全基因組研究中，TruSeq DNA PCR-Free 以 “無偏擴增、均勻覆蓋" 的參數優勢，解析腫瘤基因組的完整突變景觀：

覆蓋均勻性與(yu) PCR 偏差控製：采用無 PCR 擴增的文庫構建方式，避免高 GC 區域（如啟動子、重複序列）的擴增偏差，在 GC 含量 40%-70% 的區域，測序覆蓋度 CV 值＜8%，對人類基因組中 99.5% 的區域實現有效覆蓋 —— 在黑色素瘤全基因組研究中，該試劑盒成功檢測到 TERT 啟動子（GC 含量＞65%）的高頻突變，而傳(chuan) 統 PCR 擴增試劑盒因該區域擴增效率低，漏檢率達 30%。

測序質量與(yu) 數據產(chan) 出：支持全基因組測序深度 30×-100×，測序數據 Q30 值穩定＞90%，單樣本數據量可達 90GB（30× 深度），可精準檢測單核苷酸變異、插入缺失、拷貝數變異及結構變異（如染色體(ti) 易位、大片段缺失）—— 某科研團隊利用該試劑盒構建的肝癌全基因組突變圖譜，發現 2 個(ge) 與(yu) 肝癌轉移相關(guan) 的結構變異熱點區域，相關(guan) 成果發表於(yu) 《Nature Communications》。

樣本與(yu) 平台兼容性：支持新鮮冷凍組織、細胞係等高質量 DNA 樣本，DNA 用量僅(jin) 需 1μg，兼容 Illumina 全係列測序平台，在 NovaSeq X 係列平台上，單次運行可處理 32-96 個(ge) 樣本，單位樣本測序成本較 NextSeq 550 平台降低 60%，適合大規模腫瘤隊列研究。

（四）NextSeq 550Dx 測序試劑：中低通量腫瘤研究的 “高效搭檔"

作為 NextSeq 550 測序平台的專用試劑，NextSeq 550Dx 測序試劑以 “高穩定性、靈活通量" 參數，適配中低樣本量的腫瘤研究需求：

數據穩定性與(yu) 質量：v2.5 版本試劑采用優(you) 化的流動池設計，起始熒光強度提升 15%，運行過程中信號衰減率＜5%，300-cycle 高輸出試劑盒的最大數據產(chan) 出量達 120GB，Q30 值穩定＞90%，在 150 例乳腺癌樣本的 HER2 基因擴增檢測中，數據重複性 CV 值＜3%，檢測結果與(yu) 熒光原位雜交（FISH）技術一致性達 98%。

通量與(yu) 運行時間：提供高輸出與(yu) 中輸出兩(liang) 種試劑規格，高輸出試劑盒單次運行可產(chan) 生 400M 個(ge) 簇，支持 8-36 個(ge) 樣本的同時檢測；中輸出試劑盒可產(chan) 生 130M 個(ge) 簇，適合 4-12 個(ge) 樣本的快速檢測，300-cycle 運行時間僅(jin) 需 37 小時，較傳(chuan) 統測序試劑縮短 20%，滿足科研項目的快速周轉需求。

質控與(yu) 可追溯性：試劑配備 PhiX v3 測序對照，可實時監控測序過程中的堿基識別 accuracy 與(yu) 簇生成效率；采用射頻識別（RFID）編碼耗材，可追溯試劑生產(chan) 批次、有效期等信息，符合《臨(lin) 床基因檢測質量管理規範》，為(wei) 腫瘤臨(lin) 床轉化研究提供合規性保障。

三、參數優勢落地：典型應用場景中的研究價值轉化

場景 1：肺腺癌 FFPE 樣本驅動基因篩查

某腫瘤研究所利用 TruSight Oncology 500 試劑盒，對 200 例肺腺癌 FFPE 樣本進行驅動基因檢測：

參數應用：依托試劑盒 40ng DNA 用量、0.5% VAF 檢出率的參數優(you) 勢，成功從(cong) 18 例降解樣本（DNA 片段＜150bp）中檢測出 EGFR、ALK、ROS1 等突變，其中 3 例檢出 0.6%-0.9% VAF 的低頻 EGFR T790M 突變，為(wei) 患者後續靶向治療方案調整提供依據。

研究成果：通過該試劑盒的 CNV 檢測功能，發現 30% 的 ALK 融合患者伴隨 MET 基因擴增，提示這部分患者可能對 ALK 抑製劑聯合 MET 抑製劑更敏感，相關(guan) 結論為(wei) 臨(lin) 床聯合用藥研究提供了新思路。

場景 2：結直腸癌 ctDNA 動態監測

某臨床研究中心使用 TruSight Oncology 500 ctDNA v2 試劑盒，對 60 例結直腸癌化療患者進行為期 6 個月的動態監測：

參數應用：憑借試劑盒 0.2% VAF 靈敏度、4mL 血漿用量的參數特性，在治療 2 周期後，28 例患者檢測到 ctDNA 突變 VAF 下降＞50%，其中 25 例後續影像學評估為(wei) 疾病穩定（SD）或部分緩解（PR）；8 例患者 ctDNA VAF 持續升高，後續均出現疾病進展（PD），監測靈敏度達 92%。

研究價(jia) 值：該試劑盒的 TMB 計算功能顯示，高 TMB（＞20 mut/Mb）患者的化療客觀緩解率較中低 TMB 患者高 40%，為(wei) 結直腸癌患者的化療療效預測提供了新的分子標誌物。

場景 3：黑色素瘤全基因組突變圖譜構建

某基因組學實驗室采用 TruSeq DNA PCR-Free 試劑盒，對 30 例黑色素瘤新鮮冷凍樣本進行全基因組測序：

參數應用：利用試劑盒無 PCR 偏差、高 GC 區域覆蓋均勻的優(you) 勢，在 TERT 啟動子（GC 含量 68%）檢測到高頻突變（突變率 43%），同時發現 2 個(ge) 新的結構變異位點（染色體(ti) 1p36 缺失、7q34 易位），這些變異在傳(chuan) 統 PCR 擴增試劑盒的測序數據中未被檢出。

轉化意義(yi) ：通過全基因組突變圖譜分析，發現結構變異位點附近存在 2 個(ge) 與(yu) 黑色素瘤轉移相關(guan) 的候選基因，為(wei) 後續功能驗證研究奠定了基礎，相關(guan) 成果已申請 2 項國家發明。

四、供應保障：上海易匯生物助力參數優勢落地

優質的測序試劑盒需穩定的供應體係支撐，才能將參數優勢轉化為持續的研究成果。在科研單位領域，上海易匯生物提供試劑的現貨供應與定製化期貨服務，解決了科研單位 “緊急實驗缺耗材、長期需求難規劃" 的痛點。易匯生物的產品運營團隊表示，其現貨試劑可實現當日下單、次日送達，期貨定製服務則能根據科研周期提前 30-60 天鎖定產能，保障實驗進度穩定推進。

例如，某省級腫瘤研究所開展 “泛癌種驅動基因圖譜" 研究，需長期穩定采購 TruSight Oncology 500 與 TruSeq DNA PCR-Free 試劑盒，通過上海易匯生物的期貨服務，提前 60 天鎖定 6 個月的產能，確保每批次試劑盒的探針捕獲效率（偏差＜2%）、靈敏度參數（0.5% VAF 檢出率＞98%）一致，避免因批次差異導致的研究數據波動；期間因新增 20 例緊急樣本檢測需求，通過現貨服務當日補充 3 套試劑盒，24 小時內完成試劑到位，保障實驗如期推進。此外，易匯生物還提供 “參數匹配谘詢" 服務，協助科研人員根據實驗需求（如樣本類型、檢測目標）匹配試劑盒參數，避免因參數選擇不當導致的資源浪費。

五、行業展望：參數迭代推動腫瘤研究進入 “精準時代"

當前，Illumina 正持續推動腫瘤測序試劑盒的參數升級 —— 在靈敏度方麵，計劃將 ctDNA 試劑盒的檢出下限降至 0.1% VAF，滿足早期腫瘤微小殘留病灶（MRD）檢測需求；在覆蓋範圍方麵，擬在 TSO500 基礎上新增 50 個免疫治療相關基因，強化 “基因突變 + 免疫標誌物" 聯合檢測能力；在樣本兼容性方麵，研發單細胞腫瘤測序試劑盒，實現單個腫瘤細胞的基因突變與表達分析，解析腫瘤微環境細胞異質性。

上海易匯生物等試劑供應夥伴的深度參與，將進一步完善 “參數創新 - 供應穩定 - 技術支持" 的全鏈條服務，讓先進的測序試劑盒參數優勢更高效地服務於腫瘤研究，推動腫瘤精準醫學從 “理論研究" 向 “臨床應用" 加速轉化，為攻克腫瘤疾病提供更強有力的技術支撐。

六、結語

Illumina 腫瘤專用測序試劑盒以 “高靈敏度、廣覆蓋、強兼容" 的核心參數，為腫瘤研究提供了標準化、精準化的工具支撐，其參數優勢已在驅動基因篩查、液體活檢、全基因組分析等場景中轉化為實際研究價值。結合上海易匯生物穩定的試劑供應服務，科研機構可更高效地推進腫瘤研究項目，加速科研成果產出。未來，隨著試劑盒參數的持續迭代與供應體係的不斷完善，Illumina 將繼續腫瘤測序技術發展，為腫瘤精準研究與臨床轉化注入新動能。

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